(一) 資源生技(輔導利用區域內之特有生物資源包括特有農作物、中草藥、原住民草藥、海洋生物資源,開發高品質、高經濟價值、高安全性之生技產品)

(二) 輔導推展東部地區全面有機、無毒化農業之支援性生技產業,如GAP(優良農業生產技術)、生物肥料、動植物生長促進劑與生物防治製劑產業等

(三) 培育新 生物材料與 生理活性物質之生技產業包括醣類、蛋白質、胜月太、脂質、特化生技產品,近程發展方向以保健食品、食品添加物與生技化妝保養品為主,中程發展方向進一步朝 營養醫療品 (nutraceutical)產業發展,遠程發展目標則往生技醫藥品發展。